目前国内登记用于水稻防治恶苗病的药种主要有咪鲜胺、咪鲜胺锰盐、氰烯菌酯、乙蒜素、戊唑醇、咯菌腈、噁霉灵、溴硝醇等单剂以及多菌灵、福美双等的混配剂如多·福、萎锈·福美双、唑酮·福美双等。
适用于拌种防治恶苗病的药，国内登记的主要有南通南沈植保科技开发有限公司（电话；0513-85602100）1.5%咪鲜胺水乳剂，登记用于水稻种子包衣防治恶苗病，推荐药种比1∶100～120。江苏华农种衣剂有限责任公司（电话：0510-86601311）0.5%咪鲜胺悬浮种衣剂，登记用于水稻种子包衣防治恶苗病，推荐药种比1∶30～40。福建省莆田市友缘实业有限公司（电话：0594-3586566）0.25%戊唑醇悬浮种衣剂，登记用于水稻防治立枯病和恶苗病，每100公斤种子用纯药5～6.25克。瑞士先正达作物保护有限公司（电话：400-881-2568）25克/升咯菌腈悬浮种衣剂，登记用于水稻防治恶苗病，推荐每100公斤种子用纯药10～15克包衣或用纯药5～7.5克浸种；该公司62.5克/升精甲·咯菌腈悬浮种衣剂，含咯菌腈25克/升、精甲霜灵37.5克/升，登记用于水稻种子包衣防治恶苗病，每100公斤种子用纯药18.75～25克。扬州绿源生物化工有限公司（电话：0514-87302019、87302229）0.78%多·多唑拌种剂，含多菌灵0.75%、多效唑0.03%，登记用于水稻拌种防治恶苗病和控制生长，每100公斤种子用药233～312克。另外还有多·福、咪鲜·吡虫、多·咪·福美双、甲霜·福美双等悬浮种衣剂产品，登记用于水稻防治恶苗病等病虫害。
提示：多年来大面积生产上使用的药种主要是咪鲜胺，而且多采用浸种的方法用药。近年来，随着稻作方式的改变，特别是旱直播水稻在江苏、安徽等地大面积应用，生产上一般在播种前不浸种催芽，因而大面积水稻在播种前均不进行种子处理，由此造成恶苗病、干尖线虫病等种传病害在这些地区有加重发生和危害的趋势。选用适宜的拌种剂进行种子处理，是这些地区控制水稻种传病害的有效措施。
水稻恶苗病病菌和干尖线虫病主要在水稻种子萌发期侵入。浸种催芽时，带病稻种上的病菌和线虫会就近侵入健康种子的幼芽，原本带病率不高的种子，经浸种催芽后幼苗染病率会显著上升，高的可达80%以上，引起毁苗。因此，只要采取浸种催芽措施，必须用药进行种子处理。机插稻育秧时，播种密度高，稻种萌发出苗期在高温高湿的环境条件下带病种子上的病菌和线虫也容易侵染健康种子的幼苗，引起发病率显著上升。因此，机插稻采取播种干稻种的办法，也应用药进行种子处理，防止病害蔓延。
杀螟丹多年来在大面积生产上应用，对干尖线虫病仍有稳定的防效。水稻恶苗病病菌对多菌灵等多种杀菌剂抗性较强。咪鲜胺在大面积生产上长期使用后，很多地方已产生对该药有很高抗性的恶苗病病菌种群，近年来这些地方大面积生产上已出现使用咪鲜胺处理稻种后对恶苗病防效不佳的情况。在这些地区，换用或结合使用氰烯菌酯、戊唑醇、咯菌腈等药，有利于提高对恶苗病的防治效果，延缓病菌抗药性的产生。
