根结线虫病是保护地黄瓜上的重要病害，特别是在老菜区和复种指数高的田块，往往造成大幅度减产，应重点开展防治。
有调查发现，目前生产上还没有抗根结线虫病的黄瓜品种，也没有发现完全不被根结线虫侵染且亲和力好、对黄瓜商品性及抗逆性无负向作用的砧木，而且嫁接换根也不能解决土壤中虫源的问题。大部分黄瓜产区采取轮作、药剂防治等措施，在一定程度上能控制根结线虫病的发生和蔓延，但实际操作中均存在一定局限性。如水旱轮作效果虽好，但周期长，适用地区有限；与抗根结线虫或杀根结线虫的作物轮作，只能降低虫口密度，不能彻底清除线虫；单纯的化学防治有效期短，根结线虫病往往在植株生长中后期继续发生；采用溴甲烷等药处理土壤效果虽好，但操作难度大，而且毒性大、残留期长，同时也会杀死土壤中的有益微生物。
近些年笔者通过调研及实践，摸索出“两步法”技术，将低毒农药化学控制及水淹与日光、高温杀灭的物理控制相结合，防治保护地黄瓜根结线虫病效果好。
一是前茬活秧药剂控制。5月份越冬茬黄瓜采收进入尾声，植株虽已衰老但并未凋萎，此时根结线虫及虫卵主要集中在5～25厘米土层的黄瓜根系内。由于温度适宜，根结线虫正处于活跃期，是药剂处理的适宜时期。在收完最后一批黄瓜后不拉秧，采用灌根的方式大剂量灌入防治根结线虫的低毒杀虫剂，如每亩用2%阿维菌素乳油1～2公斤，随后再以沟灌的方式浇一次大水，有条件的采取膜下滴灌效果更好，持续滴灌3小时。这样通过渗透与吸收，药液能进入所有黄瓜根系。隔5天重复处理一次，共处理3次。
二是高温季节物理及化学控制。在7月份高温季，深翻土壤30厘米，将黄瓜残根和茎清理干净后密闭棚室，利用日光晒地7天左右。然后每亩用氰氨化钙40公斤或生石灰100公斤均匀撒在土表，再撒4～6厘米长的碎稻草、麦秸、玉米秸400公斤或腐熟有机肥1,000公斤，翻耕混土25厘米，起垄，覆盖地膜或旧棚膜，四周用土封严，从膜下垄沟内灌水至垄肩部。密闭棚室，20～25厘米土层内温度可达50℃，持续14天后揭膜通风2～3天，即可种植下茬作物。
如果棚室内根结线虫病不太严重，可采用上述任一措施就可获得良好防效，根结线虫病发生严重的棚室需结合使用上述两种措施。“两步法”采用的是低毒农药，结合高温、强光、水淹等物理方法，而且与收获期间隔远，不会造成有害残留。经“两步法”处理后，土壤中的根结线虫与虫卵被杀灭干净，生产中要注意棚室内环境的维护，避免带入新虫源，如选用无病土育苗、种子曝晒及消毒、农具专用并消毒、棚室门口放置浅石灰盘、人员进入时鞋底消毒、及时清除棚室内杂草等。如维护得当，可确保5年以上不再发生根结线虫。
