棉花苗期常见的害虫有蚜虫、红蜘蛛、地老虎、盲椿象等，注意及时防治。
蚜虫 常集中在嫩叶背面和嫩头上危害，以刺吸式口器吸食汁液。受害棉苗叶片枯黄脱落，表面还有蚜虫排泄的蜜露，易诱发煤污病。棉蚜生长发育最适温度为25℃，最适湿度为55%～85%。多雨天气不利于蚜虫发生，特别是大雨对蚜虫有明显的抑制作用，而时晴时雨、阴天、细雨对其发生有利。棉苗有3张真叶以前棉蚜危害率达10%，有3张真叶以后棉蚜危害率达15%，及时用吡虫啉喷雾防治。棉蚜大多集中在叶背危害，喷雾时注意喷头朝上，集中向叶背施药。
红蜘蛛 在叶背刺吸汁液，造成叶片失绿，出现黄斑、红斑或黄白斑，严重时造成叶片干枯脱落。对红蜘蛛危害率达10%以上的棉田，可交替使用阿维菌素、炔螨特等杀螨剂防治，药液重点喷在棉叶背面，同时兼顾全株。
地老虎 以幼虫在土壤中活动，棉籽发芽后、子叶出土前可食空棉籽，仅留下种壳；幼虫还会危害刚出土的子叶，啃食叶肉留下许多小孔；虫龄较大时可咬断棉花嫩茎，并将棉苗拖到洞口。棉花定苗前被害株率达10%、定苗被害株率达5%时，及时用药防治。可用2.5%溴氰菊酯乳油2,000倍液雾，或每亩用5%毒死蜱颗粒剂3公斤拌土撒施。
盲蝽象 主要有绿盲蝽、中黑盲蝽两种，以成虫和若虫刺吸幼嫩部位的汁液危害，棉苗受害可形成“无头苗”、“多头苗”或“破叶疯”。棉花苗期至花蕾期百株有虫3～5头时，苗床内可用敌敌畏拌土撒施熏蒸，大田可用吡虫啉、啶虫脒等药喷雾防治。相邻棉田尽量统一防治，从田四周向中间围喷，防止成虫往返迁飞影响效果。重点对嫩头、边心喷药，棉田套种的盲蝽象寄主作物应一并喷药防治。盲蝽象早晚活动能力弱，施药效果较好。
