在我国发生的小麦锈病有3种，即条锈、叶锈和秆锈。小麦条锈病主要发生于西北、西南、黄淮等冬麦区和西北春麦区，病害流行年份可造成减产20%～30%，严重地块甚至绝收。小麦叶锈病以西南和长江流域发生较重，华北和东北部分麦区也较重。小麦秆锈病在华东沿海、长江流域和福建、广东、广西的冬麦区及东北、内蒙古等春麦区发生流行。
    用药拌种是防治小麦锈病的有效手段。四川红种子高新农业有限责任公司（电话：028-82637688）的24%唑醇·福美双悬浮种衣剂，含福美双21%、三唑醇3%，登记用于小麦包衣种子防治锈病，每100公斤种子用纯药160～200克。山东滨农科技有限公司（电话：0543-3358550）的25%三唑醇干拌剂，登记用于小麦拌种防治锈病，每100公斤种子用纯药34～37.5克。也可以选用立克秀60克/升戊唑醇悬浮种衣剂，每100公斤麦种用制剂50毫升加适量水拌种或包衣种子，对小麦锈病也有良好防效。在江苏、安徽等地，锈病病菌越夏困难，每年的菌源主要由外部传入，在春季发生和危害，拌种防治锈病意义不大。
    春季小麦发生锈病后，应在发病初期及时用药防治。目前登记用于小麦喷雾防治锈病的药剂主要有戊唑醇、丙环唑、氟环唑、己唑醇、烯唑醇、三唑酮、粉唑醇、百菌清、醚菌酯、嘧啶核苷类抗菌素、苯甲·环唑、烯肟·戊唑醇等。结合防治小麦纹枯病、白粉病等，使用戊唑醇、丙环唑、氟环唑、己唑醇、烯唑醇等三唑类药，对小麦锈病有良好的兼治效果。